达安科普:看这里!超全分子诊断技术解析

IVD资讯 2024-01-22 09:26:55

近年来,随着生物学和临床医学的高速发展,以及对诊断精准度的迫切需求,分子诊断技术得到了发展飞速。

分子诊断技术主要是用分子生物学标记物对病原体遗传物质包括DNA、RNA等进行检测,从而达到疾病预测、诊断以及随访监测的目的。

分子诊断技术从技术原理看,可以将上市分子诊断技术大致分为PCR技术、测序、分子杂交技术、质谱以及生物芯片技术。

1985年,美国科学家Kary Mullis发明了基于分子诊断技术的PCR技术,并于1993年获得了诺贝尔化学奖,至今已有超过30年的发展历史。基于分子诊断技术的PCR技术就是聚合酶链式反应技术,通过体外提存DNA,在热启动 Taq 酶等聚合酶的作用下,经过变性、退火、延伸等步骤,对DNA进行百万级扩增,从而达到荧光定量PCR仪可以检测的量。

1、PCR技术(基于分子诊断技术之核酸检测)

基于分子诊断技术的PCR技术目前已经发展到三代,从定性、定量到数字PCR技术,但是最常用的还是定量技术,也就是咱们常说的荧光定量PCR技术(Real-Time PCR)。通过在反应体系中能够监测病原体的数值变化,为临床提供精准的检测数据,从而指导用药,在肝炎、肠道、生殖道等病原体的应用中已经非常普及。

数字PCR技术是目前一直在深入研发的技术,可以用于肿瘤基因突变检测,真菌感染检测。相比荧光定量PCR技术,该类分子诊断技术的检测线更低,检测范围更广,但是由于技术不是非常成熟,目前还是用于科研居多。

2、基因测序技术(基于分子诊断技术之核酸检测)

基于分子诊断技术的基因测序技术最经典的是sanger测序技术,也就是一代测序技术,在HIV耐药、肝炎耐药中应用普遍。

目前临床常用的分子诊断技术是NGS,也被称为高通量测序技术,通过DNA提取、DNA文库构建、DNA扩增、测序,最后进行生信分析等步骤将病原体的遗传物质进行全面的检测。由于临床对于病原体了解的迫切需求,NGS在病原体的检测中已经非常常见,每次检测可以达到几万种病原体同时检测,检测通量非常高。除此以外,在肿瘤和遗传方面也有非常好的应用,对于临床中的疑难杂症,可以多方面筛查,精准发现致病原因。

但是该分子诊断技术也存在很多缺点,例如检测时间较长,检测费用昂贵,没有确定的临床标准,对于检验人员的专业要求非常高。随之而来就诞生了第三代测序技术,该技术以单分子为目标的边合成边测序,该技术不需要PCR扩增,可直接对单分子进行检测,测序成本进一步降低,可以直接读取DNA或者RNA的序列。该优势大大改善临床基因测序的成本、速度。但是这也意味着通量有限,并不适合做全基因组测序,所以目前临床普及度最高的还是二代测序技术。

3、分子杂交技术(基于分子诊断技术之核酸检测)

基于分子诊断技术的分子杂交技术,是利用DNA变性与复性的原理,在某些物质的作用下DNA双链解链后,在DNA复性重新形成双螺旋结构时,把放射素标记的DNA单链分子或者DNA与RNA的混合物放在同一溶液中进行反应,通过分子杂交与目标基因进行结合,从而把目标基因显示出来,像电泳、PCR溶解曲线,都是这一技术的延伸。

该技术在地贫基因检测中应用较为常见。该技术的一大缺点是结果需要人工判读,带有一定的主观判断;部分检测仪器还未实现自动化,手工操作的步骤较多。

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4、核酸质谱技术(基于分子诊断技术之核酸检测)

基于分子诊断技术的质谱技术与其他分子诊断技术不同的是,它是基于被测生物标志物本身分子量、结构等化学性质进行直接分析的方法,是生物结合化学的定量检测技术。

与常规PCR技术相比,该技术的灵敏度更高,特异性更强,具有多指标、高效率、高通量的特点。同时,该项分子诊断技术可以融合蛋白组学、代谢组学等学科领域,通过对疾病特异性标志物的分析,达到对临床疾病的诊断、治疗以及疗效检测的目的。

但是由于该项分子诊断技术壁垒较高,目前国内很多厂家都是贴牌国外厂家的设备,售后服务会有很多问题,所以临床推广的应用还不算普及,但是科研的需求一直是持续上涨的。随着临床对新技术的强烈需求,质谱技术必然也会在临床也会有一席之地。

5、生物芯片技术

最后我们再来讲讲基于分子诊断技术的生物芯片技术,该项分子诊断技术是通过微缩技术,根据分子间特异性相互作用的原理,将基因序列或者蛋白质包贝于芯片或者微球上,再将被生物素标记的DNA、RNA或者蛋白质与目标序列进行结合,然后用显色液与生物素发生化学反应,通过检测显色的信号值反向检测目标遗传物质或者蛋白质。对于同时有DNA和蛋白质检测需求临床客户来说的话,该项分子诊断技术是一个非常好的选择。

目前生物芯片技术广泛应用于地贫基因突变/缺失筛查,耳聋基因筛查、蚕豆病等疾病领域,具有较高的灵敏度,检测快速,通量虽然没有NGS高,但是相比PCR技术、分子杂交技术来说,通量得到的较高的提升。但由于设备较高,操作复杂,干扰因素也比较多,目前也只有大三甲医院有所普及。

6、分子诊断技术总结

以上是对分子诊断技术的全面介绍。分子诊断技术虽然都是基于遗传物质进行拓展的,但是检测方法各不相同,也各有优缺点。

基于分子诊断技术的荧光定量PCR技术由于技术成熟、检测速度快,备受临床欢迎。其他分子诊断技术包括基因测序、质谱、生物芯片等技术作为高端分子诊断技术,可以对荧光定量PCR技术进行有效补充,随着精准医疗和个体化医疗的持续普及,相信这些高端检测技术必然会在临床快速普及,让更多的病患获益。

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