华南军政长官公署由广东绥靖公署改称。广东绥靖公署主任原为宋子文，1949年1月18日行政院决定，宋子文专任广东省主席，所兼广东绥靖公署主任一职，由余汉谋担任。2月19日任命徐景唐、吴奇伟、陈策、梁华盛为副主任。7月21日任命李及兰为副主任。8月24日将广东绥靖公署改为华南军政长官公署，以余汉谋为军政长官。辖广东、广西两省，同年7月东南军政长官公署成立后，海南岛名义上归其统辖，实际军政事宜归华南军政长官公署节制。同年秋华中军政长官公署自武汉经湖南撤退到广西，广西即归华中军政长官公署节制。华南军政长官公署辖区只有广东一省。10月中旬广州解放，该长官公署迁到海南岛，于同月底撤销，所属军政人员归海南岛防卫总司令部指挥。

1949年3月广东绥靖公署辖第三十九、第一〇九、第六十二、第六十三、第六十四军以及广东省保安部队所组建的5个师和海军第四军区司令部等部。6月第二十一兵团自青岛撤退至粤，隶属该绥靖公署。10月中旬，广州解放，所辖一部被歼，一部撤到海南岛。

华南军政长官 余汉谋，广东高要人，保定陆军军官学校第六期毕业，粤军陈济棠旧部，两广事变后接替陈职掌广东军政。

第四兵团司令 沈发藻，江西大庾人，黄埔军校第二期、陆军大学第四期毕业。

第二十三军（中央军）军长 刘仲荻，江西龙南人，日本千叶陆军步兵学校、意大利热那亚军事学院毕业。

第七十军（中央军，原何键派湘军）军长 唐化南，湖南零陵人，黄埔军校第四期、陆军大学第十期毕业。

第十二兵团司令 胡琏，陕西华县人，黄埔军校第四期，土木系将领。

第十八军（中央军）军长 高魁元，山东峄县人，黄埔军校第四期毕业。

第十九军（中央军）军长 刘云瀚，江西大庾人，中央陆军军官学校第七期毕业。

第六十七军（中央军）军长 刘廉一，湖南长沙人，黄埔军校第六期、陆军大学正则班第十六期毕业。

第二十一兵团司令 刘安祺，山东峄县人，黄埔军校第三期毕业。

第三十二军（中央军，原商震派晋军）军长 赵琳，山东泰安人，黄埔军校第三期毕业。

第三十九军（中央军）军长 程鹏，贵州织金人。

第五十军（中央军）军长 胡家骥，湖南湘乡人，黄埔军校第五期毕业。

海南特区警备总司令 陈济棠，广东防城（今属广西）人，广东陆军速成学校毕业，原陈济棠派粤军首领，两广事变后失势。

第六十四军（粤军）军长 容有略，广东中山人，黄埔军校第一期毕业。

第六十二军（粤军）军长 李宏达，广东五华人，黄埔军校第六期、中央训练团高等教育班毕业。

第六十三军（粤军）军长 刘栋材，广东蕉岭人，广东黄埔陆军速成学校、陆军大学将校班第三期毕业。

第一零九军（中央军）军长 邓春华，广东琼州（今属海南）人，广东法政专门学校、黄埔军校第一期毕业。