日报3000期|刘永鑫:我与《热心肠日报》共同成长

向雪的手记 2024-09-12 09:34:37

2016年3月4日,《热心肠日报》第1期发布于“热心肠研究院”微信公众号,正式开启了日日不息、第一时间以信息产品形式传播全球肠道科学研究前沿进展的旅程。如今,她已成为“中国肠道人的必读文献”,2024年9月7日迎来第3000期!

值此之际,我们特别邀请日报的超级粉丝、忠实读者、创作者,与您分享“我与《热心肠日报》的故事”。

《热心肠日报》伴随了我加入微生物组领域的8年,从2016年日报读者出发,2017年“宏基因组”公众号主编并兼职日报编辑,到2019年主导微生物组实验手册同时兼职日报生物信息方向主编,再到2021年与热心肠研究院共同创办iMeta期刊,并以历史最快速度的3年获得微生物学科研究类期刊影响因子全球第一,直至2024年创办子刊iMetaOmics期刊和iMeta大会。总结这8年的历程,主要分为萌芽、成长、主导、轻狂、担当五个阶段,借此文以记录自己的成长。

阶段一|萌芽

2016年6月我博士后出站,当时几乎走到了学术生涯被淘汰的边缘,博士阶段成果没有SCI文章,博士后阶段也没有,别人博士后出站找独立位置,我连基本的助研或讲师资格都远远达不到。很幸运被同事推荐认识了刚回国开展植物微生物组的白洋老师,也因为近5年零成果被迫走支撑岗位以工程师身份才勉强留所入职,开始了我的微生物组研究之路。

入职后的第一周就听了一场蓝灿辉老师在微生物所的报告,第一次全面了解了菌群领域,开始关注《热心肠日报》并加入了热心肠菌群#5微信群。从此我基本每天必读日报至今,早已成为我每天晨读的重要部分。同时开始发挥自己生物信息学背景在微生物组中的优势,每天系统学习前沿文献,开展重复文章分析并积累大量笔记。第一年的学习我就发现本领域中文技术方法资料几乎空白,而我有道云笔记中的几百篇菌群分析学习经验如果分享出来,也许可以帮助很多与我相似处境的同行。是时候该做点什么了!

阶段二|成长

2017年7月,我创办了“宏基因组”公众号,将自己大量的学习笔记开始系统整理,保持每天分享,成为全国最早分享扩增子、宏基因组等系列教程的平台。本想交上几十个同行朋友可以交流技术和经验,经过7年发展已经有近16万同行、1.6万的同行好友。而且从我的个人分享,到几百位科研同行参与,如今“宏基因组”公众号成为本领域分享技术、成果、经验和招聘的最具影响力平台之一。

同时期我也开始在《热心肠日报》任兼职编辑,好处是在日报编辑后台可以获得最新的文献推送,更及时获得领域的最新进展,200字短科普在日报发布,对感兴趣的成果精读学习后全文翻译并发布在宏基因组公众号,可谓一举两得。经过长期坚持输入和输出,自己也快速成长,2018年发表了第一篇我主导分析的中国科学生命科学(Science China Life Science),作为期刊封面论文并被引200余次。2019年初,我主导负责的微生物组分析项目接连在Nature Biotechnology、Science发表,此后年均过百次的引用都成为相关领域研究的高被引论文。

阶段三|主导

2019年,Bio-protocol出版社在浙江大学蒋超教授的推荐下联系到我,共同发起《微生物组实验手册》项目。经过一年的策划与约稿以及一年的审稿与发行,这本由100余家单位、300多位同行共同编写的80万字专著于2021年底正式完成,架起了各类研究对象通往微生物组的桥梁。

2020年初获得人生的首次英文约稿,也是Chinese Medical Journal通过热心肠研究院找到我,以《A guide to human microbiome research: study design, sample collection, and bioinformatics analysis》为题发表了我第一篇最后作者文章,目前被引百次,有效地拉动了国产期刊的发展,期刊也从当时的1.5上升为目前的7.5,实现了4年4倍的增长。热心肠研究院和Protein & Cell联合发起微生物组专刊第二版,我也有幸以第一作者兼通讯作者贡献一篇《A practical guide to amplicon and metagenomic analysis of microbiome data》,被引500余次并入选高被引论文,也见证了期刊从7.5上升到21.1的三倍奇迹增长。

阶段四|轻狂

2021年,“宏基因组”公众号每天分享的高水平论文仍然基本来自国外期刊,亚太地区微生物学和菌群领域的高水平期刊长期空白,就不能创办一本中国人主办的本领域顶刊吗?答案当然是可以的,我们等到了天地、地利与人和。天时,是当年有3本中国期刊影响因子突破20分,其中2本材料学新刊获得首个影响因子,让我国在3~4年内成功创办IF 20+顶刊成为现实。地利,是中国文章发表量世界第一,微生物学英文成果占世界1/4但高水平期刊长期空白。人和,是我们有多个10万+关注的公众号和500人专家同行微生物群,成功编写《微生物组实验手册》的项目经验。

虽然有部分同行、师长特别不看好这一办刊想法,但95%的同行都非常支持,尤其是得到了热心肠日报、生信宝典两个10万+公众号的支持,让我们拥有50万的粉丝基础,实现了快速创刊、高举高打。历经3年,iMeta期刊获得了首个影响因子23.7,位于微生物学科研究类期刊全球第一,高于大家过去公认的Nature Microbiology、Cell Host & Microbe等专业领域顶刊,真正实现中国速度与中国高度!

阶段五|担当

2024年,iMeta期刊再出发,1月确定创办子刊iMetaOmics,6月文章陆续上线,8月第一期18篇文章正式发行,2024 iMeta大会也将于10月举办。未来两年,我们还计划创办iMetaGut、iMetaGenome、iMetaBioinfo三本子刊,成熟构建创新科研生态。

《热心肠日报》3000期,历时8年时光、3000多个日夜,我个人从几乎零成果的出站博士后成长为博士生导师,今年9月将入学我名下的第一个博士,同时会有一名博士即将出站。《热心肠日报》不仅与我共成长,目前也是学生每天的必读内容。我坚信,未来是星辰大海,未来总是未可知,坚持做一件事并持之以恒,就是最优秀的品质,就一定会获得成功!

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向雪的手记

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