抗战胜利后，李先念部与王树声、张震部合并组建中原军区，下辖2个纵队，三个二级军区。司令员李先念，政委郑位三，副司令王树声兼任一纵司令，副司令王震兼任参谋长。

曾担任新四军5师参谋长的刘少卿，却很尴尬，并没有被正式任命职务。

从兵力来说，三支部队中李先念力量最大，其次是王树声部，然后是张震部。曾在5师被誉为“总长”的刘少卿没担任中原军区职务，让人多少不可理解。

说起来，他是有“气”。

在1945年1月，他被抽调去延安，按说他在5师的分量不轻，各方面都是他负责。虽然去延安参加七大学习，汇报工作等。但根据地都需要他，当命令传达时，他也愣住了。

或许心里有想法，但还是同意服从安排。

随后，上级把文建武安排担任参谋长，也就是说此时的他已经在5师没有职务了。可抵达豫西后，渡黄河出现困难，而滞留了。又遇到王树声部队，跟着他们行动个把月。抗战胜利后，王树声部与李先念部会合，他也跟着去了。

组建中原军区前，李司令找他谈话，希望他担任军区参谋长，上级也是同意的。可他来气了，说自己的威信没了，当什么参谋长。说了一些牢骚话，最终李司令尊重他的选择，参谋长由王震兼任。他依然留在李先念身边协助工作，实际上没有职务，这样也导致日后在处理工作时，没话语权。

王震是一个有能力的人，长期干军政主管工作，也养成了有些事自己就做决定的习惯。这使得军区首长有时候有些被动，而且他不在司令部，下面人有事还是找刘少卿。

在一些作战方面中，李司令与刘少卿认为可以，可王副司令有其他考虑，有些战斗没有发打。如打双沟镇，5师部队战斗力相比35旅还是弱一些，希望359旅出手，可359旅在此前粤湘地区战斗，兵力在损耗，认为如今部队都是骨干，不能损失在小战斗中等。

刘少卿无法坚持作战态度，因为在军区领导班子中，他没有职务，如果有也只能是李司令身边的参谋长，而非军区参谋长。对于当初没有当参谋长，刘少卿或许认为自己是赌气放弃职责，要是自己现在是作战序列的参谋长，在作战方面多少也能有点分量。

1946年1月随着停战令生效，刘少卿被调去军调部工作。

他在北平的军调部工作，敌人的野心也逐渐暴露，调集重兵围困中原军区。6月敌人发起进攻，我部主力向西两个方向突围。部队经历不断突破封锁作战，最终突围成功，代价也是巨大的。

此时，刘少卿在北平，没有赶上与战友们一起突围作战。后全面内战时，军调部也就不复存在，我方人员撤回延安。刘少卿在后方休养一段时间后，要求去东北，最终交通线封锁留在华东打仗。