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DNASTAR Lasergene 19.0 升级上线

Lasergene 19.0 在蛋白、基因组及转录组分析流程迎来重磅更新。通过全新算法体系、优化的蛋白质设计力场、集成式

Lasergene 19.0 在蛋白、基因组及转录组分析流程迎来重磅更新。通过全新算法体系、优化的蛋白质设计力场、集成式注释工具、SciNote ELN 联动能力以及升级的本地与云端建模服务,搭配更人性化的操作流程,帮助科研人员高效处理数据、便捷开展协作,显著提速整体科研工作。

蛋白质结构与相互作用

Protean 3D 为结构预测与蛋白质设计带来了全新的灵活功能。

• 可通过 Protean 3D 内统一的结构预测向导,调用 Boltz、AlphaFold-Multimer、NovaDock 以及 NovaFold 抗体预测模块开展分析。

• 每套 Lasergene 蛋白质模块授权均附赠多项免费云端蛋白质建模预测服务,可应用于各类建模预测场景;也可根据需求额外增购预测额度。

• 支持本地运行 Boltz、NovaDock 及 NovaFold 抗体预测,保障数据安全,同时使用不受限制。

• 借助预测向导,可基于同一固定输入文件,搭配多种可变蛋白或配体结合物,批量完成多项结构预测配置。

• 蛋白质设计过程中,可选用多种 Amber 力场。

变异分析

Lasergene 基因组学模块大幅提升序列组装速度,并拓展了分析流程的适配范围。

• 可对 Element 测序平台产出的数据开展组装与分析

• SeqMan NGen 组装性能完成优化,相较 Lasergene 18.1 版本,处理速度最高提升一倍

• 依托自动化精度检测与完整的捕获区域性能指标,完成序列组装结果核验

基因组可视化

GenVision Pro 新增数据轨道并搭载基因检索功能。可在分析视图中启用数据轨道,快速定位以下位点:

• 开放阅读框(ORFs)

• 剪接位点

• 转录因子结合位点

从头基因组组装

SeqMan NGen大幅优化长读长从头组装性能。

• 依托改进的比对算法,提升序列组装速度,生成更长的重叠群

• 结合AUGUSTUS预测工具与Swiss-Prot数据库信息,自动完成组装结果注释

• 简化组装参数选择流程,让实验流程配置更便捷

抗体组库分析

SeqMan NGen 新增单细胞 V (D) J 抗体组库分析转录组学测试版分析流程。该流程可完成 B 细胞克隆型鉴定,并从 10x Genomics 免疫谱测序数据中获取配对抗体链序列。

• 支持分析人、小鼠来源的 10x Genomics 单细胞 B 细胞受体(BCR)免疫谱 FASTQ 数据

• 结合识别条形码的从头组装技术与内置本地 IGBlast 注释功能,获取抗体重链与轻链配对序列

• 借助 Protean 3D 中的 Boltz 及 NovaFold 抗体算法,完成克隆型识别、序列有效性评估,并预测抗体结构与抗原结合能力

对接 SciNote 电子实验记录本(ELN)

SeqBuilder Pro 现已实现与SciNote electronic lab notebook (ELN)联动,助力实验室优化数据管理、协作效率、数据溯源能力,并满足合规监管要求。

• 可将 SeqBuilder Pro 对接任意付费版本的 SciNote 电子实验记录本

• 支持将序列、项目文件、图片、引物设计方案及虚拟克隆流程保存至 SciNote 并统一管理

• 依托电子签名、审计追踪、自动报表以及美国 FDA 21 CFR 第 11 部分合规等功能,强化数据溯源,提升团队协作水平

其他功能优化

Lasergene 19.0 在多款应用程序及功能模块中,新增多项易用性与辅助访问功能:

• 借助 DNASTAR 导航工具,可结合 AUGUSTUS 预测结果与 Swiss-Prot 数据库信息,对 FASTA 文件自动完成注释

• 通过 DNASTAR 导航工具调用 PubMLST 数据库,完成微生物菌株鉴定

• SeqMan NGen 开展转录组测序组装时,支持选择每百万条读长中每千碱基转录本数(TPM)作为标准化方式

• 手动录入序列或设置 BLAST 检索条件时,多款 Lasergene 组件可语音播报核苷酸及氨基酸残基信息