吕纪能靠院体花鸟绘画做到锦衣卫指挥衔位。
他画树枝用的是明代少见的拖墨法，边缘晕出的毛边像刚被秋风扫过，画鸟羽毛的丝缕根根分明，连脚爪扣住树皮的发力感都能看清。他的丛菊用石黄加了细砂点瓣，摸上去都有颗粒质感，完全不是随便点染的文人“墨戏”花鸟。
他最绝的是把南宋院体的工细和浙派的猛劲揉在了一起，画鸟不软，画花不媚，难怪当时宫廷里出高价抢他的画，现在存世的真迹加起来都不到百幅。