在军队改革前，总后勤部司令部为正军不是副大军区级单位。在2016年军队改革中，总后勤部调整组建为军委后勤保障部，原总后勤部司令部架构也随之改变。
在2016年军队改革前，总后勤部司令部主要在后勤首长的领导下，组织协调后勤建设相关工作，主要职责包括组织领导后勤保障、战备、训练和军事行政等活动。其工作成效对后勤建设和保障部队作战胜利具有重大作用。
不过在2016年军队改革中，总后勤部调整组建为军委后勤保障部，原总后勤部司令部的架构也随之改变。
在2016年军队改革前，总后勤部司令部存在多个部门，像信息化局等。但在军队改革中，原解放军总后勤部已调整组建为军委后勤保障部，原总后勤部司令部架构也发生了改变。
原总后勤部曾下设司令部、政治部、财务部等7个二级部，原总后勤部司令部的具体部门构建已随体制改革成为历史情况，如今重点聚焦于以新体制开展后勤保障工作。
