曾文溪保卫战，刘永福带领两千黑旗军硬刚两万日军一个月，最终仅剩十余人，此后台南失守，台湾落入日本之手。刘永福带着黑旗军鏖战一个月后，最终日军增兵至两万八千人，刘永福带着黑旗军拿着自制地雷砸向日军，地雷扔完后，与日军展开了惨烈的白刃战，最终刘永福受了重伤倒在了血泊中，台南没有了屏障，日军顺势占领了台南城。 很快黑旗军副首领曾阿富带着几人回救刘永福，在死人堆里将伤重的刘永福和冯相锟救了出来；之后将黑旗军将士火化，再装上渔船，准备送刘永福与冯相锟回内地。但曾阿富说什么都不愿意走，他要留下在台湾坚持抗日，他的家就在台湾，他要与侵台日军抗争到底。 在船上的刘永福醒了，他看了一眼刘成良与船上受伤的士兵，想起了一件重要的事，但他因为伤重说不出话来。只见刘成良走到船的甲板上，将白布掀开，上面全是黑旗军牺牲将士的骨灰坛子，刘永福这才放心了！他想起了二十余年来黑旗军的征战岁月，他们音容笑貌还在眼前。如今黑旗军仅十来号伤员了，刘永福的热泪泉涌而出。 接下来他们在南澳岛登陆，南澳黑旗军家属们正在热切盼望着他们的家人归来。很快刘永福夫人黄美兰看到骨灰坛上写着的是女儿刘秀蓉的名字，瞬间就明白了一切；她再也忍不住嚎哭了起来，最后伤重的刘永福被抬了出来；他已说不出一句话来，或许他想对乡亲们说对不起，没有将黑旗军将士带回来，更想对台湾人民说声对不起，自己没有守住台湾。 而刘永福虽然回来了，但在台湾的黑旗军并没有消失，曾阿富扛着黑旗军的旗号转入山林抗日，吸引了更多的志士，后来出了简大狮、柯铁虎、林少猫等一大批抗日英雄；而从1895年之后，日本侵占台湾的五十年里，因抗日而牺牲的义军居然高达六十五万之多； 刘永福最终回到家乡广西钦州，1911年辛亥革命时，七十四岁高龄的刘永福被推举为广东民团总团长，加入了推翻清王朝的斗争中。而台湾最后一任巡抚唐景菘回京后被革职返乡，晚年热衷戏曲不问世事，和当年那个抗法英雄简直是天壤之别。 后来在1944年发生了一件非常解气的事情；一架从菲律宾逃回日本的飞机在台北上空坠毁，恰好撞上了日本在台北的乙未战争的日本神社，引起了大火；直到1945年中国抗日战争取得胜利，台湾及其澎湖列岛重新划入中国的版图。
