《两千年间》以宏阔视角审视中国两千年帝制社会的结构性痼疾，揭示了官僚系统如何从秦汉的进取工具蜕变为明清的腐朽牢笼。作者通过制度分析指出，科举制在打破世袭垄断的同时，也造就了脱离实际的文人官僚；土地兼并的周期性爆发与脆弱的农业经济形成死循环；而儒家思想的官学化则扼杀了思想活力。书中尤为深刻的是对"超稳定系统"的剖析——这个通过周期性崩溃实现再生的系统，最终在近代遭遇了真正的文明危机。这种制度性反思至今仍发人深省。