永祚寺的名字来源于“君子万年，永锡祚胤”最早可溯源到明万历二十七年为振太原文风而修建的文峰塔。明万历三十六年，晋穆王朱敏淳邀请五台山妙峰禅师在文峰塔的基础上主持修建了永祚寺和佛塔。妙峰以卓越的智慧和丰富的经验，完成了寺院建设，整个寺院做南朝北，东西双塔对峙而成的“双塔凌霄”成为太原古八景之一。永祚寺是国内现存唯一一座全部采用砖仿木无梁建筑组成的寺院，大雄宝殿和三圣阁堪称明朝最为经典的无梁殿建筑之一。