大兴善寺始建于西晋。隋朝时期，阇那崛多、达摩笈多等僧人来到大兴善寺译经弘法。唐开元年间，印度僧人善无畏、金刚智、不空先后来到大兴善寺继续弘扬佛法。唐朝高僧一行、惠果在印度佛法基础上，整合形成了中国密宗佛教。隋唐时期是大兴善寺的鼎盛时期，是长安三大译经场所之一，是唐朝密宗佛教发源地，被公认为密宗祖庭。