御朱印最早起源于寺庙巡礼的传统。过去参拜者会将自己抄写的经文（写经）奉纳给寺庙，寺庙会在纳经帐上盖印，作为“纳经”的证明。因此，领取御朱印的行为也被称为“纳经”。
现在，只要参拜完寺庙或神社，通常奉纳300～500日元，就可以获得一枚御朱印。专门用来收集御朱印的小册子叫做「御朱印帐」。
有些神社会直接在御朱印帐上书写御朱印，也有些神社会先写在纸上，再交给参拜者自行贴在御朱印帐里。
以下是青森县内可以获得御朱印的部分神社（不完全版）：
[一R]广田神社
[二R]善知鸟神社
[三R]久须志神社
[四R]岩木山神社
[五R]诹访神社
[六R]十和田神社
[七R]八甲田神社
[八R]高山稻荷神社
[九R]猿贺神社
[一R][零R]芜岛神社
