以色列和土耳其历史上冲突不少。2010年5月31日的马尔马拉号事件就引发了两国紧张外交局势。当时以色列海军突袭试图驶入加沙沿海地带的土耳其籍国际人道主义救援船只“马维·马尔马拉”号。以色列军方称登船时遭攻击才开火还击，而“自由加沙运动”则表示以军趁着夜色从直升机降落登船后立即开火，造成八名土耳其籍人死亡。
还有今年4月7日，以色列驻伊斯坦布尔领馆附近传出枪声并发生武装冲突。1名袭击者被打死，2名受伤，2名土耳其警察受轻伤。目前袭击者身份和动机还在调查中，这一事件也让两国关系再度蒙上阴影。