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高分辨率成像揭示了纳米级核组织结构

通过DNA-PAINT成像实现哺乳动物细胞核中多种不同蛋白质的纳米级组织。图片来源:Mahipal Ganji实验室印度

通过DNA-PAINT成像实现哺乳动物细胞核中多种不同蛋白质的纳米级组织。图片来源:Mahipal Ganji实验室

印度科学研究院(IISc)团队突破性改进 DNA‑PAINT 技术,首次在癌细胞核内同时可视化12种生物分子,绘制细胞核精细结构图谱

印度科学研究院(IISc)——印度科学研究院(IISc)的一组研究人员近日在《Nature Communications》上发表了一项里程碑式研究,利用改进的 DNA‑Points Accumulation for Imaging in Nanoscale Topography(DNA‑PAINT)显微技术,首次在单个癌细胞核内同时可视化12种关键生物分子,并实现了3–5 nm级别的超高分辨率成像,为细胞核结构的系统性解析提供了前所未有的“原子级”图谱。

细胞核内的多分子“同框”视角

人体由数万亿个细胞组成,每个细胞内都聚集着数百万种蛋白质、核酸及其他重要分子。正如生物化学系副教授马希帕尔·甘吉(Mahipal Ganji)所说:

“构建能够在单个细胞中可视化多种生物分子的创新技术,是推动生物学研究边界的关键。”

传统的荧光成像只能一次性显示两到三种分子,无法全面描绘细胞内复杂网络。为此,研究团队改良了 DNA‑PAINT 技术——这是一种利用短链荧光 DNA 标签与细胞内特定目标短暂结合,并在激光照射下产生“闪烁”信号的超分辨率成像方法。

“目前,传统方法仅能捕捉三种分子。能够一次性观测更多分子将为细胞组织学的深入洞察打开新窗口。”
— Micky Anand(BC博士生,联合第一作者)

关键技术突破

多目标标签化

研究团队成功设计出可同时识别12种目标的 DNA 标签组,五种标签具有更快、更持久的结合特性,使图像锐度显著提升,细节可解析至3–5 nm的尺度。

低能量激光与细胞安全

通过使用高亲和力标签,显著降低了成像所需的激光能量,从而减少了 DNA 标签与细胞的光损伤。

显著加速成像流程

传统 DNA‑PAINT 在可视化单一分子时需耗时数小时,而改进后,9‑plex(九重)成像可在不到四小时内完成,极大提升实验效率。

揭示转录抑制下的分子重组

新技术让研究人员能够观察到当细胞转录过程被阻断时,核内蛋白质与其他分子如何重新排列,提供了疾病状态下分子动态变化的第一手资料。

“了解蛋白分布在病变细胞中的变化,可能为早期疾病检测打开新途径。”
— Abhinav Banerjee(BC博士毕业生,现为 Janelia 研究院(HHMI)博士后,联合第一作者)

“通过在纳米尺度精准定位多种生物分子,我们能够深入揭示它们之间的相互作用及在疾病中的改变。”
— 同上

研究意义与展望

此项研究不仅提供了细胞核结构的详细“地图”,更为未来在癌症、遗传疾病等领域的早期诊断与靶向治疗奠定了技术基础。研究团队计划进一步扩展到更多细胞类型,并结合单细胞组学,构建更完整的细胞内分子网络模型。

勇编撰自论文"High-speed multiplexed DNA-PAINT imaging of nuclear organization using an expanded sequence repertoire".Nature Communications.2026相关信息,文中配图若未特别标注出处,均来源于自绘或公开图库。