没有马达加斯加的飞航许可，赖清德返航乘坐的专机只能绕一个大弯，至少多飞行3000公里，时间也要增加好几个小时。
另外，为了安全起见，赖清德的专机返航线路比去程更偏南，穿越印度洋后，经过菲律宾巴拉望岛上空，从最南端进入台湾本岛。