一九三四年，不知什么原因，“中马城”弹药库爆炸。后来，东北抗联频繁袭扰，石井四郎下令炸毁原有的建筑设施，一九三六年春，在哈尔滨平房地区重新修建细菌培养基地。七七事变后，石井四郎称，可以将感染鼠疫菌的跳蚤，大规模应用于战争。之后，731部队又接收了大连卫生研究所。