区分细菌和病毒感染，在症状上有显著差异。细菌感染时，局部症状更为突出。例如扁桃体炎，嗓子会出现红肿、化脓的情况，疼痛十分明显。由肺炎链球菌引发的肺炎，咳嗽时可能伴有黄痰。
病毒感染则更常见全身症状，像流感，会出现高热、乏力、肌肉酸痛等症状。并且在病毒感染早期，血常规显示白细胞一般正常或偏低，而细菌感染时白细胞通常会升高。
治疗方法也有所不同，细菌感染常用抗生素治疗，病毒感染大多使用抗病毒药物。不过，要准确区分二者，还需听从医生的诊断，不能自行盲目判断。 两者一个是细菌，一个是病毒，生存环境不同，结构也不一样。