1945年，马麟病故于河州。马步芳亲自前往临夏参加葬礼，行至甘青交界处时，被马麟的家人阻止道：亡人生前有言，他死后不要你进门，你最好不要去！马步芳听后，只好悻悻返回西宁。

马麟死时七十一岁，在病榻上特意叮嘱了这么一句话，说明那口气在心里憋了许多年，一直没有散去。马步芳大概也清楚，马麟的恨不是无中生有，是马步芳自己一步一步逼出来的。

1932年，胡宗南率国民党中央军第一师驻扎天水，蒋介石借中央势力向西北施压，马步芳坐镇西宁，感觉到局面不对劲。恰在这时，玉树地区爆发了藏僧和青海商人之间的货物价格纠纷，本不过是民间摩擦，马步芳却有意把事态扩大，借这个口子推动昌都藏军于当年6月进入玉树，局势骤然升温。

马步芳随即以"平叛护疆"为由主动请战，率宁海军出击，几个月下来，藏军全线溃败，马军兵进昌都，与川军刘文辉部联合施压，藏方被迫于1933年4月与南京国民政府签订《青藏和约》，战事收场。

这一仗打完，胡宗南进占青海的打算彻底落空，蒋介石对马步芳的倚重反而更深了。而名义上仍是省主席的马麟，在整件事里几乎没有任何存在感，地位愈发有名无实。

马麟并非没有根基的人。1929年河湟事变之后，马麟亲赴河州出任宣抚副使，每天在西乡渡口放船接渡流离失所的汉民返乡，还率先捐款重建了被战火烧毀的河州华寺拱北，在河州回族各界积下了真实的人望。

1936年前后，青海地方财政一团糟，政府职员和各学校教员的薪资长期拖欠，马步芳暗中推波助澜，授意西宁教员和工作人员当街拦住马麟讨要欠薪，场面激烈，闹出了流血冲突。

外间同时传出消息，说马麟私设商栈，滥发"青海省金库维持券"从中牟利，还把国民政府拨付的十个月行政经费，整整200万元秘密转运回老家私藏，教育经费和军费同样大量中饱私囊，政府职员整整一年无薪可领，民间怨声载道。这些消息在西宁迅速发酵，马麟声誉急剧下滑。

1938年初，国民党军训部长白崇禧来青海视察，马麟百般逢迎，结果没讨到半点好脸色，当场遭到白崇禧斥责，而白崇禧与马步芳之间却亲热得很。当年3月2日，南京国民政府正式下令，免去马麟青海省政府主席职务，由马步芳接任，马麟调任国民政府委员，有名无实，就此彻底出局。

马麟带着秘书王启奎、副官王登云回到癿藏，此后再没踏入西宁一步。退居癿藏的几年里，马麟前后强购当地农民土地逾二万二千亩，又耗资千余万元兴建了周围五华里的"凤林园"，亭台楼阁、珍禽奇兽，一应俱全。

甘青两省大小官吏每年登门送礼，临夏地区的两任专员和五县县长也年年来此孝敬，没有人敢招惹马麟。1943年，临夏新任专员李学模甚至因为听说马麟的名头，迟迟不敢赴任，最后是马麟亲自出面做保，李学模才敢前来上任。

1945年1月26日，马麟在癿藏病故，临终前交代家人，不许马步芳来送葬。

马步芳站在甘青交界处被挡了回去，心里究竟是什么滋味，史书没有记载。但那道拦在路口的人墙，大概比任何话都清楚——马麟用了整整七年，等到死的那天，才把这口气彻底说明白。