日本侵华期间，1928至1945年日军在华制造的重大惨案，均有权威史料佐证。(不完全统计)。

一、东北地区惨案（1931–1945）
1. 平顶山惨案（辽宁抚顺·1932）：日军报复抗日武装，围村集体枪杀、焚村，遇难3000余人，仅3人幸存。

2. 清原三堡惨案（辽宁清原·1933）：无辜平民遇难约1200人。

3. 731部队人体实验（黑龙江哈尔滨·1932–1945）：日军秘密开展鼠疫、炭疽、冻伤实验及活体解剖，平民、战俘等遇难至少1万人。

4. 阜新万人坑（辽宁阜新·1936–1945）：强制奴役煤矿劳工，肆意虐待、活埋，遇难至少7万人。

5. 大同煤矿万人坑（山西大同·1937–1945）：残酷压榨劳工、肆意虐杀，遇难约6万人。

二、华北地区惨案（1928–1945）
1. 济南惨案（山东济南·1928，侵华前奏）：日军阻挠北伐，肆意屠戮军民，6000余人遇难，爱国外交官蔡公时惨遭残杀。

2. 华北多地屠杀（1937年7-8月）：卢沟桥事变后，廊坊、通州、天津近郊等地，日军大肆枪杀、活埋平民，各地遇难数千人。

3. 平型关屠杀（山西繁峙·1937）：日军屠戮无辜平民2000余人。

4. 镇江惨案（江苏镇江·1937）：日军入城后烧杀奸淫，遇难4525人，3万余间房屋被毁。

5. 南京大屠杀（江苏南京·1937.12–1938.1）：日军持续六周实施枪杀、活埋、火烧、奸杀等暴行，超30万平民和战俘遇难，为人类史上重大惨剧。

6. 潘家峪惨案（河北丰润·1941）：日军报复抗日根据地，围村纵火、机枪扫射，1230余人遇难，含445名儿童，33户人家绝户。

7. 平山三光惨案（河北平山·1941–1943）：日军推行“三光政策”，其中老虎洞惨案就有1500名平民被烧死、枪杀。

8. 北疃惨案（河北定县·1942）：日军施放毒气、持枪屠杀，800余名老弱妇孺无辜遇难。

三、华中地区惨案（1937–1945）
1. 苏州惨案（江苏苏州·1937）：日军攻占苏州后屠戮平民、战俘，共计1万余人遇难。

2. 无锡东亭惨案（江苏无锡·1937）：1821名平民遇难，504名妇女被欺凌，1.3万间房屋被烧毁。

3. 花园口决堤（河南郑州·1938）：人为决堤阻敌叠加日军轰炸屠杀，引发特大洪灾，300余万人遇难，1200万人流离失所。

4. 洪山惨案（湖南岳阳·1942）：1800余人遇难，600余名妇女被欺凌，2180间房屋被毁。

5. 厂窖惨案（湖南南县·1943）：短短4天，日军水陆围剿屠戮，3.5万余名平民、战俘遇难。

6. 沙市惨案（湖北沙市·1939）：2000余人遇难，4000余间房屋被损毁。

四、华南、西南地区惨案（1938–1945）
1. 重庆大轰炸（1938–1943）：五年半无差别轰炸居民区、商业区，造成约10万人遇难，15万人受伤，城市建筑损毁惨重。

2. 重庆六五隧道惨案（1941）：空袭避难民众拥堵隧道，因缺氧、踩踏窒息，约2500人遇难。

3. 海南琼崖大屠杀（1942–1945）：日军在海南肆意屠戮，仅文昌南阳一地，就有1000余名平民遇难。

五、全域细菌战、化学战罪行
1. 浙东细菌战（1940–1942）：日军在宁波、衢州、义乌空投鼠疫、霍乱、炭疽病菌，数千人遇难，区域瘟疫长期肆虐。

2. 常德细菌战（湖南常德·1941）：日军空投鼠疫跳蚤，数月内超1万名平民感染遇难。