黄金部队已于2018年整体退出现役，改制为公益一类正局级事业单位。正军套改正局，没降级，也没升级，算平级转隶属关系。

2018年3月，机构改革方案明确黄金部队移交自然资源部。
2018年8月：正式退出现役，并入地质调查局。
2019年2月：转制改革方案落地，明确编制与管理规则。

2020年8月28日：新机构在北京市挂牌运行。

原武警黄金指挥部，改建为自然资源综合调查指挥中心，正局级

原有总队、支队等，整合为13个专业地质调查中心。3个正局级中心、10个正处级中心，均为公益一类事业单位。整体编制大约1万人，转为财政补助事业编制。

改制前专注黄金矿产勘探，保障国家黄金储备。改制后开展各类地质调查、多金属矿产勘查等工作。

原武警黄金技术学校于2006年合并升格为武警警种指挥学院。该校原址如今是地质调查局地球物理调查中心襄阳培训基地。