【中国科学家成功完成甘蔗基因组测序!】甘蔗是人类最大的食用糖来源,但它有时候却很让人头疼。它是个极端的多倍体,细胞里塞了10到12套染色体,基因组大而混乱。过去二十年里,科学家始终只能读懂部分片段,而给甘蔗的基因组测序始终是个地狱级的难题。为什么这么难呢?
所谓基因组测序,就是把染色体里的全部DNA按照顺序依次解读出来。但一条DNA有上亿个字母,没有一种机器能连续工作这么长时间,因此必须将一条DNA砍成许多小条带,分别读出顺序,再按照上下文关系像拼图一样把它们拼回去。而甘蔗的基因组有着10-12套极其相似的DNA……
不过最近,中国热带农业科学院热带生物技术研究所与中国农业科学院深圳农业基因组研究所等联合团队,共同完成了甘蔗品种POJ2878的全染色体完整基因组,并揭示了甘蔗从野生植物驯化为全球最主要产糖作物的遗传密码。
经过了大量的算法迭代和新系统开发后,团队最终组装出了POJ2878这一甘蔗品种(外号“甘蔗之王”)的全体基因组序列图谱。不仅如此,他们还明确了在甘蔗的不同部位中,到底是哪些基因在执行不同的任务。
从新图谱中可以发现,从全新的基因组图谱能够看出,现代甘蔗由其两个原始祖先物种杂交而来,二者各自贡献了部分染色体,这些染色体在杂交过程中如同拉链一般相互交错、嵌合组装。并且在多套染色体里,同一基因的不同拷贝并不总是平均干活。团队还抓到一个关键靶点SUS基因,品种里这个单倍型拷贝数越多,蔗糖含量越高。科学大院
