6月29日，中国商务部宣布对40家日本实体实施新制裁，其中20家列入出口管制管控名单，20家列入关注名单。至此，受管制日本实体总数增至80家。这是继今年2月后的又一次升级行动，管控范围从传统军工企业延伸至防卫研究所等多家智库与科研机构，直指日本军工研发源头。
商务部新闻发言人表示，中方曾多次制止日方错误行径，但日方不仅不思悔改，反而加速“再军事化”，部署进攻性武器、境外发射导弹。此次将管控从企业端延伸至知识孵化与科研支撑体系，标志着中方从预防性管控升级为惩戒性反制，意在向日方传递明确信号：执意推进军事扩张，将面临更精准深入的打击。
日本政府连续两天提出抗议。内阁官房长官木原稔称中方措施“不可接受”，防卫大臣小泉进次郎要求撤回并作出解释。然而，日方渲染“中方刻意针对”的论调站不住脚——中方仅针对涉军两用物项，不波及民用贸易。日方所谓“制裁无用”的说法，不过是安抚国内舆论的托词，实则日本稀土等战略物资高度依赖中国，管控升级将带来实质压力。
外交部发言人郭嘉昆指出，中方举措完全正当合法，旨在遏制日本“新型军国主义”妄动，希望日方“迷途知返”。分析认为，若日方继续推进军事扩张，中方可能进一步收紧两用物项与战略原材料出口。中方留有缓冲空间，并非“下死手”，但反制不会止步。日方若想改善中日关系、维护经贸合作，就必须切实纠错，停止挑衅中国的危险行为。