郑耀先潜伏军统十四年，滴水不漏，可曾墨怡牺牲后，军统不仅知晓有卧底，还掌握“风筝”代号。直到晚年审讯，袁农才道出根源。
当年袁农为救未婚妻违规发电打探风筝，情报被影子截获；又擅自刺杀郑耀先，间接害死程真，还逼问陆汉卿，致使陆汉卿为护风筝撞竹签自尽。
袁农曾向江万朝打听风筝，江万朝是牺牲的江心之父，疑点全部指向他。郑耀先被关押后写信举报江万朝，信件传到北京，钱部长亲自提审化名周志乾的郑耀先。
郑耀先亮出蓝宝石戒指，又有坚冰作证，证实自己就是风筝。陈国华难以接受双手沾满鲜血的鬼子六是自己人，钱部长却明白潜伏工作的苦衷。
郑耀先打草惊蛇，对外宣称抓获老牌特务，引得台湾派人联系江万朝。江万朝贪恋安稳不愿配合，主动自首。
他坦白当年受酷刑叛变，妻子梅芬绝望自尽，自认是戴笠安插的影子，悔恨之下服毒而亡。殊不知他只是掩护真影子的弃子。
整部《风筝》道尽隐蔽战线的悲壮。郑耀先半生背负骂名、忍辱负重，无数无名特工牺牲自我，才换来家国安宁。