广为流传的“孔子杀少正卯”一事，出自战国晚期书籍《荀子·宥坐》篇，而此篇不是荀子本人撰写的。唐代注家杨倞早已注明：《宥坐》《子道》《法行》《哀公》《尧问》这末尾五篇，是荀子的后传弟子搜集摘抄的杂记、传闻故事汇编而成，不能作为信史。
孔子在世时的一手史料《论语》《左传》《春秋》，对此并无记载，疑为后人杜撰。
从制度上讲，大夫有罪，必须经国君与公卿议定，臣子无权擅杀同僚，孔子摄相七日即杀名士，并不符合当时礼法，况且孔子正是极力推崇礼法之人。