据共同社、《朝日新闻》等多家日媒9月8日报道，消息人士透露，美方曾向日本政府承认冲绳县多地水体中检测出的有害物质极有可能来自驻日美军基地，也允许对外公开这一美方立场，但日本政府选择掩盖此事，将该立场从公开文件中删去。据日媒8日最新报道，驻日美军曾在2023年12月时向日本政府承认普天间基地和嘉手纳基地极有可能是污染源，并告诉日本政府可以对外公开此事。然而，日本政府选择不对外公开，仅告诉冲绳县政府美方拒绝接受调查。针对此事，冲绳县知事玉城丹尼8月接受记者采访时批评了日本政府的做法。他再次重申有必要进入美军基地调查污染源。日本内阁官房长官木原稔8日被问及此事时称，他不会透露日美双方沟通的细节。