Rstudio 跑单细胞转录组,终于调出 UMAP 分qun图啦🥳左边运行 Seurat 代码,右边直接可视化细胞亚qun,不同颜色代表不同细胞类型。
很多临床同门想尝试单细胞,一上来就被 Seurat 包劝退。
💡简单科普:UMAP 属于降维聚类,把海量单细胞ji因表达信息压缩到二维平面,直观区分不同细胞qun,是单细胞文章里的核心图,用DimPlot()绘制。
✅单细胞基础流程:质控→标准化→PCA 降维→细胞聚类→RunUMAP→细胞注释⚠️新手坑:不要只追求图好看,细胞注释才是重头戏,marker ji因选错,整张图直接作废。
普通转录组门槛低,适合新手发小文章;单细胞数据量大、代码复杂,适合想冲高分的小伙伴。单细胞代码调试、细胞注释、图表美化有问题,都可以来聊聊。#生信分析 #科研日常 #生物信息学 #科研狗 #科研学习 #R语言
