北洋政府陆军部于1912年4月29日成立，是管理全国陆军行政事务的最高军事机关，其前身可追溯至1906年清政府改组设立的陆军部。
民国元年（1912年）
陆军总长 段祺瑞，3月任，北洋系中仅次于袁世凯的二号人物，北洋集团军事体系的实际构建者。
陆军次长 蒋作宾，4月任，同盟会早期成员，革命派嵌入北洋中枢的代表，也是南北军权交接的象征性人物。
民国二年（1913年）
陆军总长 段祺瑞，11月亲往汉口“劝驾”，武力催逼黎元洪北上赴职；12月暂代湖北都督，完成对湖北控制权的交接。
陆军总长 周自齐，12月暂兼，袁世凯心腹，旧交通系巨头，也是袁称帝的核心支持者之一。
陆军次长 蒋作宾
民国三年（1914年）
陆军总长 段祺瑞，2月代领河南都督，主持剿匪声势浩大的白朗起义；5月重任总长一职。
陆军次长 蒋作宾
陆军次长 徐树铮，5月任，段祺瑞的头号心腹谋士，袁世凯统治后期皖系势力崛起的关键人物。
民国四年（1915年）
陆军总长 段祺瑞，因受袁世凯父子排挤，于5月以“生病”为由请假离职；8月正式免去陆军总长职务。
陆军总长 王士珍，8月任，“北洋三杰”之首，袁世凯制衡皖系势力最重要的人物。
陆军次长 蒋作宾
陆军次长 徐树铮，6月以“订购外国军火浮报”为名免职。
陆军次长 田中玉，6月任，北洋老牌嫡系，明确支持袁世凯称帝，且与王士珍关系亲近。
民国五年（1916年）
陆军总长 王士珍，4月调任参谋总长。
陆军总长 段祺瑞，4月兼任。
陆军次长 蒋作宾，5月调任参谋次长。
陆军次长 傅良佐，5月任，皖系“四大金刚”之一，段祺瑞在陆军中枢的直接代理人。
陆军次长 田中玉，6月调任察哈尔都统。
陆军次长 张士钰，6月任，北洋老牌嫡系，原为袁世凯心腹，袁病逝后转而依附段祺瑞。
民国六年（1917年）
陆军总长 段祺瑞，5月因第一次府院之争被黎元洪免职。
陆军总长 王士珍，6月任；7月因卷入张勋复辟事件辞职。
陆军总长 段祺瑞，7月代理；11月因武力统一政策彻底破产辞职。
陆军总长 王士珍，11月任；12月以“政务繁忙，无法兼顾”为由辞职。
陆军总长 段芝贵，12月任，皖系核心重臣，段祺瑞掌控中枢、推行武力统一政策的关键助手。
陆军次长 傅良佐，8月调任湖南督军。
陆军次长 徐树铮，8月任，11月因武力统一政策彻底破产辞职。
陆军次长 张士钰
民国七年（1918年）
陆军总长 段芝贵，3月免；同日任。
陆军次长 张士钰
民国八年（1919年）
陆军总长 段芝贵，1月调任京畿卫戍总司令。
陆军总长 靳云鹏，1月任，12月免，同日兼任，皖系“四大金刚”之首，地位远高于傅良佐、徐树铮等人，是段祺瑞用来平衡直、奉、总统府三方关系的核心联络人。
陆军次长 张士钰，1月授予博威将军，位列将军府。
陆军次长 罗开榜，1月任，皖系骨干将领，长期负责北洋军事后勤、军械人才培养。
陆军次长 张志潭，1月署，段祺瑞亲信幕僚，与靳云鹏交好，和徐树铮矛盾极深。
民国九年（1920年）
陆军总长 靳云鹏，5月以能力不足为由辞职，8月因与曹锟、张作霖均有深厚渊源得以兼署。
陆军次长 罗开榜，5月暂代总长，8月遭直系清算，为规避追责请辞。
陆军次长 张志潭，8月调任内务总长。
陆军次长 金绍曾，8月任，技术官僚，直系整顿陆军部的关键人物，多次代理总长。
陆军次长 何恩溥，11月任，直系军官，背景较为中立，是曹锟用来填补陆军部权力空缺的人选。
民国十年（1921年）
陆军总长 靳云鹏，5月因无法平衡各方利益被迫辞职。
陆军总长 蔡成勋，5月任，老牌直系骨干，直系掌控中央军权的标志性人物，12月以援赣总司令身份率部南下，在击败北伐军后接任江西督军。
陆军总长 鲍贵卿，12月任，奉军头目，张作霖在北京政府的代言人。
陆军次长 金绍曾
陆军次长 何恩溥
民国十一年（1922年）
陆军总长 鲍贵卿，6月因第一次直奉战争中奉系全面战败被免职。
陆军总长 吴佩孚，6月署理（坚持推辞不就），直系军阀二号人物，时人有“曹锟占总统之名，吴佩孚握中央之实”的评价。8月免职。
陆军总长 张绍曾，8月署理，“士官三杰”之一，直系内部平衡曹锟、吴佩孚两派的关键人物。
陆军次长 金绍曾
陆军次长 何恩溥，1月免职。
陆军次长 韩麟春，1月任，鲍贵卿亲信，奉系安插在陆军部的代表性人物，5月因第一次直奉战争中奉系全面战败被免职，随后受杨宇霆邀请投奔张作霖。
陆军次长 金永炎，5月任，黎元洪核心幕僚，黎在军界的主要代理人。
民国十二年（1923年）
陆军总长 张绍曾
陆军次长 金绍曾
陆军次长 金永炎，7月因大总统黎元洪被曹锟逼走下台被免职。
陆军次长 王坦，7月兼代，10月署理，曹锟亲信，曹锟贿选的核心操盘手之一。
民国十三年（1924年）
陆军总长 张绍曾，1月因与曹锟、吴佩孚的政治主张冲突被免职。
陆军总长 陆锦，1月任，曹锟亲信，曹锟统治核心圈内的实权人物，10月因北京政变曹锟政权倒台被免职。
陆军总长 李书城，10月任，同盟会早期骨干，冯玉祥政变的核心参与者，11月因段祺瑞正式上台组建新政府被免职。
陆军总长 吴光新，11月任，皖系“四大金刚”之一，段祺瑞复出的核心功臣，一定程度上维系了执政府作为各方共主的平衡。
陆军次长 金绍曾，11月因北京政变曹锟政权倒台被免职。
陆军次长 贾德耀，11月任，皖系骨干，并与冯玉祥关系密切，是平衡皖、奉、国三方势力的核心人选。
陆军次长 王坦，11月因北京政变曹锟政权倒台被免职。
陆军次长 张厚琬，11月任，张之洞嫡孙，奉系骨干，奉系插手中央军权及协调奉皖关系的关键人物。
民国十四年（1925年）
陆军总长 吴光新，12月因段祺瑞失势主要请辞。
陆军总长 贾德耀，12月受皖、奉、国各方都认可得以出任。
陆军次长 贾德耀，12月升任陆军总长。
陆军次长 熊斌，12月任，冯玉祥核心幕僚，执政府内少有的连接南方革命力量与北方国民军的人物。
陆军次长 张厚琬，12月因病请辞。
陆军次长 齐振林，12月任，北洋陆军部资深技术官僚，熟悉中枢军政运作，仅负责陆军部日常行政事务。
民国十五年（1926年）
陆军总长 贾德耀，4月因段祺瑞失势下野去职。
陆军总长 陆锦，5月被吴佩孚推举出任，当月因张作霖奉系逐渐掌控北京中枢去职。
陆军总长 张景惠，5月任（未就），张作霖结义兄弟，奉系元老，张作霖掌控北京政局的核心联络人。
陆军总长 蒋雁行，8月署理，吴佩孚核心智囊，在北洋军政界资历深厚。
陆军次长 熊斌，因国民军败北去职。
陆军次长 齐振林，因段祺瑞失势下野去职。
陆军次长 金绍曾，6月因长期在北京政府陆军部核心层工作，并受直奉各方接受而得以出任。
陆军次长 何恩溥，6月因属直系旧人，且长期在北洋陆军部任职而得以出任。
民国十六年（1927年）
陆军总长 蒋雁行，1月因吴佩孚部为北伐军击溃而去职。
陆军总长 张景惠，1月因安国军政府成立得以出任。
陆军次长 金绍曾，1月因安国军政府成立而去职。
陆军次长 何恩溥，1月因安国军政府成立而去职。
陆军次长 王树常，1月任，奉系骨干，奉军中少有的兼具中枢参谋经验和一线带兵履历的专业军事人才。