在2025财年，F - 35第五代战斗机项目未能达成新的作战能力目标。其主要缘由在于软件方面的问题，这致使技术更新2（TR - 2）和技术更新3（TR - 3）配置的作战测试出现延迟。

五角大楼作战测试与评估主任的年度报告显示，最新的TR - 3软件版本40R02“不适用于专门的作战测试”。而最新的TR - 2版本30R08，由于稳定性欠佳、能力不足以及不断被发现存在缺陷，在该年度“基本处于无法使用的状态”。

这一情况反映出长期以来严重软件问题的发展态势，对该项目的开发进程形成了阻碍。

报告指出，在2025财年，开发团队研发了两条相互独立的软件线，分别适配不同的硬件基线。大部分机队依托较为陈旧的TR - 2软件，采用单一基线；而部分配备第二基线的新型飞机，则是为更优地支持TR - 3软件而专门设计。

升级后的TR - 3航电系统意在为未来的Block 4任务系统能力提供支撑。该系统的开发被视作具有战略关键性，然而却多次遭到推迟。尽管F - 35此前的规划中早已拟定具备Block 4标准的大部分相关能力，但预计要到2030年代初期方能达成。

F-35A在德克萨斯州沃斯堡生产中

最新报告表明，最新的软件版本30R07与30R08的研发耗时超出预期，并且需要比预计更多的软件迭代次数来弥补不足。此外，这两个版本在交付时或预计交付时所具备的能力均低于最初计划。其后果是，在缺乏实质性能力提升的情况下，40系列TR - 3软件的研发进度进一步滞后，且累积了新的缺陷。目前，这些软件延迟问题已对该项目的运行测试能力造成影响。

与越南战争时期代码量仅为1000行的F - 4A战斗机以及早期第五代、代码量达170万行的F - 22战斗机相比，F - 35战斗机拥有高达570万行的代码，这也是其系统复杂性居高不下的主要原因之一。

作为全球范围内唯一正在进行生产的、与北约标准兼容的第五代战斗机，F - 35项目所存在的问题对美国及其盟友的安全利益有着尤为重大的影响。特别是在美国面临来自中国尖端第五代和第六代战斗机项目的同等挑战这一关键时期，其影响更为凸显。

中国J-20第五代战斗机，2016年首批量产批次

2025年2月，作战测试与评估主任的年度报告显示，F - 35项目在使该战机达到长期延迟的TR - 3标准方面面临着持续的困境。此前，这一问题致使所有战斗机交付工作暂停，并且一直对该项目造成严重干扰。

TR - 3软件对于F - 35执行高强度作战任务而言至关重要，其服役时间的延迟对全球隐形战斗机机队的作战潜力产生了重大影响。

同年9月，空军第461飞行测试中队接收了一架独特的、专门配备仪器的F - 35A战斗机。此举旨在加快新软件测试进度，推动软件全面升级至TR - 3标准。

TR - 3标准原本预计在2020年初左右达成，这一标准的实现本应为配备Block 4标准的F - 35战机在2025年左右投入作战奠定基础。

海军陆战队F-35C和海军F-18E/F战斗机在超级航母亚伯拉罕·林肯号上

依据2025年9月针对F - 35项目开展的审计，政府问责办公室发布的报告表明，将F - 35升级至Block 4标准的现代化工作正面临着愈发严峻的延误问题。即便升级范围已大幅缩减，开发和安装计划内的改进仍需两年时间方可完成。

报告指出，第四区块将会出现“能力削减、进度延迟且成本不明”的状况，并且强调“第四区块将由”原66项功能的子集……以及后续增添的能力所构成。

自2月28日美以对伊朗发起攻击以来，F - 35缺乏Block 4软件的负面影响已清晰显现。由于其F - 35机队在可用武器方面受到极大限制，缺少包括对防空压制行动极为关键的AGM - 88G导弹在内的任何空对地导弹。而这些能力要到2030年代初Block 4标准姗姗来迟地达成时才能得以实现。