康熙皇帝平定了三藩，收复了台湾。清朝东南地区就算是安定下来了，但北方的势力对大清的威胁实际上是更为严重。公元1644年清军入关，满洲最富裕和最有战斗力的人都南下了，造成了满洲地区军政实力的急速衰败。对于向南迁徙的清政权来讲，东北满洲地区，虽然是龙兴之地，现在已经成了边疆地区，甚至有点鞭长莫及。而沙俄帝国向东边疯狂殖民，所以大清和俄罗斯在明清交际那会就接壤了。
沙俄对远东的地理概念很模糊，不知道莫斯科离北京到底有多远，派哥萨克人一路往东殖民下去，收获越来越多，北亚地区的达斡尔人被迫臣属了沙俄，东部殖民地产出的兽皮源源不断的送到了莫斯科，成了沙俄跟英国、荷兰贸易的重要的出口货物。比如海豹皮、海狸皮，在当时都非常昂贵。沙俄用毛皮换来了大量西欧先进的火火炮，国力越来越强。尝到甜头的哥萨克就写信告诉沙皇，300人就能够平定黑龙江，这有大量的矿石和珍贵的紫貂皮，而且永远不会缺粮。沙皇就授意抢。
沙俄入侵东北路线
哥萨克人在血腥殖民的过程当中，也得到了一些大清国的情报。首先知道了中国皇帝的军队都有火器和大炮。其次听说中国皇帝的都城非常大，全都是石头墙，骑马要跑好几天才能绕一圈，就认为300人不能搞定大清了，最后只招募到了一百多人参加远征。沙皇就更是个逗逼，要这几百人的远征军荡平大清，还让带一封国书交给中国皇帝。内容特别搞笑，意思就是“沙皇伟大而威严是众王之王，所向无敌，中国应该归顺沙俄，成为沙皇的奴仆，如若不降，无差别杀光中国的男女老幼，以示惩戒”。
沙俄二世
是俄国的探险家，叫流氓头子或者叫土匪都行，叫哈巴罗夫，带着信和几百个人就踏上了荡平中国的旅途。在黑龙江一带大肆烧杀抢掠，并且在清朝顺治七年（公元1650年）夺取了雅克萨地区，在这建了一个城寨，成为沙俄远征军的据点。当时在这居住的达斡尔人手里只有弓箭和长矛，面对哈巴罗夫的火枪和大炮必然是力不从心，结果当然是一边倒。而掠夺了这么多资源的哥萨克们并没有因此富裕起来，因为好东西都上交给了沙皇。
大清此时还没有完全掌控中国的局势，一边跟农民军残余势力打，一边跟南明打，忙得不可开交，结果又被俄罗斯人打进老家了，简直是屋漏偏逢连夜雨，于是就找到属国朝鲜帮忙。朝鲜受到宗主国的指示，怎么也得出兵意思一下，清朝还有一个目的，知道朝鲜对大明一向藕断丝连，借此机会试探一下朝鲜的忠诚。
朝鲜火铳手
朝鲜陆军战斗力比较强的就是鸟铳兵。朝鲜的火铳技术是跟入侵的倭寇学的。大清就要求朝鲜派这支军队来增援，于是朝鲜选拨了100名鸟铳精兵，加上随行的翻译、旗鼓手、辎重兵，一共152人就出发了。清朝派了300名八旗兵和300名赫哲军。赫哲是满族比较亲近的民族，原来属于野人女真，算是东北的土著。
顺治十一年（公元1654年），朝鲜军和东北清军汇合。两支军队在松花将就遭遇了入侵的400名哥萨克，战争立刻爆发。整整打了八天，朝鲜的鸟铳手表现非常英勇，击溃了哥萨克军队，让他们放弃了抢掠松花江的想法。俄军残兵在头目斯捷潘诺夫的带领下，逃到了黑龙江上游搭建城堡，准备长期驻扎。清朝决定乘胜追击，彻底消灭这批部队。
在17世纪的时候，攻坚战很难打，俄军火器多，清朝在东北力量又不强，一直没有打下来。直到顺治十五年的七月，八旗军出动了大部队来围剿哥萨克，见识到上次朝鲜军战斗力的清朝，要求朝鲜再次派兵相助，朝鲜就再一次派兵增援。这一仗清军1400人加上朝鲜兵200人，对阵500俄军。虽然后来沙俄也派了援兵，但这一仗仍然打成了歼灭战。
一战雅克萨
清军准备完善，三天之后，俄军大败。头目斯捷潘诺夫以下270多人被打死，10人被活捉，其余逃散。后来也多半冻、饿死在西伯利亚的深山老林之中。沙皇征服行动受阻，又派了数支部队分头入侵黑龙江地区，都被击败。此后雅克萨地区更是反复的易主，零星战斗从来没有停止过。到后来沙俄就以尼布楚为中心，建立了一大批城寨当做根据地，频频出城掠夺周围的土地。面对坚城，大清的野战部队没办法，整个局面变的非常被动，沙俄侵略者经常出来抢妇女，老人、孩子一律杀死，东北地区老百姓只能不断的南迁，南望王师又一年，苦俄久矣。
直到康熙皇帝亲政之后，大清在东北地区漫无章法的作战方式开始改变。朝廷里有很多欧洲来华的传教士，这些人知道全球地理情况的，就告诉皇上，莫斯科到北京的距离非常远，沙俄怎么可能有这么大的疆域？还派部队过来那是不可能的，这就是一小批逃犯之类的人过来捣乱。但是哥萨克的军事行动越来越多，甚至黑龙江上下游都快被他们控制了。
康熙已经认为沙俄是一个强大的邻国，而且这几十年的入侵应该是沙皇派来的正规军，如此就必须限制他们向南延伸的触角。可是用什么借口呢？
之前有一位达斡尔的酋长叫根特帖木尔，世代居住于尼布楚一带。由于不堪忍受俄国侵扰，顺治十年南迁到嫩江流域，正式接受了大清的统治。结果是个墙头草，后来又因为司法不公等原因，选择叛逃到了俄国。这么一来就成了大清对沙俄的战争借口。康熙皇帝就跟沙俄要人，把根特帖木尔这个叛徒还给大清，哥萨克认为不交人肯定挨揍，要交了人，土地和人口就得被大清收回。所以就拒绝救人。
康熙皇帝的数学和天文地理知识都非常牛，知道黑龙江和莫斯科之间的距离，更知道沙俄最多就派几百人的部队来，因为一路上根本就没法给大军补给。通过汤若望等西欧传教士了解到沙俄在欧洲根本就算不上什么强国。所以康熙皇帝亲自勘察黑龙江地图，统筹安排后期补给，打造舰船，调精兵猛将与前线对垒。东北各族百姓看到大清的部队终于来了，纷纷诛杀哥萨克，为家人报仇。
清朝与俄国、准噶尔疆域图
派的黑龙江将军萨布素，虽然是行伍出身，遇到康熙这个伯乐之后，摇身一变成为大将。康熙22年，也就是收复台湾的那一年，沙俄在黑龙江流域的据点就只有雅克萨一处了，萨布素要求户部多给些粮食，被户部否决。康熙皇帝为了鼓舞士气，御令户部依照萨布素的要求，拨粮，不得延误，还让科尔沁部把上交朝廷的粮草直接转运给黑龙江。沙皇也知道康熙帝要动真格的了，就向雅克萨增兵，双方都想在雅克萨决战。
大清此时已经收复了台湾，康熙皇帝下令从福建水师向黑龙江调遣400名双层藤盾兵。这兵种善于水战，虽然不能完全阻挡火绳枪的弹丸，但其他弓箭类武器丝毫伤不到。把重步兵配置在黑龙江流域的舰船上，是为了保护运粮船。
从康熙的后勤安排，可以看得出来，他懂得打仗，外行看战术，内行看后勤，兵马未动，粮草先行。皇上不差饥饿兵，饿了得吃饭，冷了得穿衣，跑路得穿鞋，病了得有药，伤了得有医，这是军队生存下来的保障。
康熙24年（公元1685年），清军水陆并进围住了雅克萨。众将商定夜间袭城，佯攻南门，主攻北门，命令副都统雅钦、迎门校尉胡布诺等人前往南门，设立盾牌土垄，以强弓硬弩压住阵脚，吸引守军注意。同时命护军参领瓦哈纳、汉军提督刘兆奇统帅精锐部队掩护红衣大炮向城门移动，主攻北门，命令护军参领博里丘、营门校尉乌沙等人在东西城门用神威将军炮夹击敌人，最后命令雅其纳率战舰进至雅克萨城东南处支援围攻部队。
清军彻夜猛攻，炮声动天，城内多处起火，守军死伤惨重。第二天，清军在三面城墙之下堆积柴火，准备焚烧城寨。因为雅克萨城是木头的，不是石头垒的，沙俄督军托尔布津只能投降。众将认为皇上有好生之德，就准许雅克萨守军投降，条件就是让雅克萨人滚出雅克萨地区。
康熙命令黑龙江将军萨布素移师到齐齐哈尔，增设了很多通信驿站，以便黑龙江的军情可以更快的到达北京，之后又丈量土地，把中原的农业生产技术引入黑龙江地区。黑龙江的崛起就是从这个时候开始的。
萨布素
大清拔掉了雅克萨据点之后，康熙帝认为罗刹人不敢回来了，在雅克萨就没驻军。
托尔布津在败退途中遇到了从尼布楚来的100名援军，又得到了由拜顿率领的600人的增援。沙俄军队没有信守不在犯边的誓言，迅速重新占领了雅克萨城。这次他们加强了城墙工事，增加了大量的火力配置，并且备足了两年的口粮，挖掘水井，准备长期固守。康熙皇帝得知之后，龙颜大怒，看来是不知死活，所以命令大军拿下雅克萨城之后直扑他们在远东的老巢尼布楚，彻底剿灭远东的沙俄势力，把罗刹人斩尽诛绝。
一年之后，双方都做好了准备，大战一触在即。沙俄部队认为自己的火力优势很大，就采取了出城野战的策略，以阻挡清军红衣大炮接近城下，一时之间，枪炮齐鸣，清军以大量火炮压制沙俄火炮，俄国士兵就只好退回城中。看到城外的罗刹人被打回去之后，水师舰队行至上游，截断了沙俄从尼布楚到雅克萨的增援通道，陆军则把雅克萨城市团团围住。由于城墙太过坚固，清军久攻不克，众将决定在城外筑高台炮楼，居高临下轰击城内守军。这么一来，沙俄士兵就只能出城野战，统帅托尔布津也战死城下。
雅克萨之战
眼看雅克萨城朝夕不保，清军却得到了撤军的命令，这是因为朝廷不想跟沙俄彻底撕破脸，战争只是外交手段的一种延伸。开战前城内800多守军，只有66个人活了下来，幸存的人都半死不活。康熙帝命令萨布素医治沙俄的士兵，并且给予他们的粮草，对他们十分宽大。
雅克萨战役结束之后，康熙命大学士索额图和14岁的皇太子胤礽一起带着使者团出发，前去跟沙俄谈。正当使团向北方进发的时候，事情起了变化。塞北大漠风云突变，准噶尔汗葛尔丹率3万铁骑袭击喀尔喀蒙古，失败后的喀尔喀各部开始南下，向大清寻求庇护，而葛尔丹在沙皇俄国的支持下，在西北称霸。康熙得到情报之后，令使团撤回内蒙境内，不能如期前往沙俄，另商谈判时间和谈判地点，最后换到了相对安全的尼布楚去商讨条约。
最后达成的条约就是中俄《尼布楚条约》，从法律上划分了两国东部的边界，尼布楚附近的土地归沙俄，雅克萨区域的土地归大清，双方以额尔古纳河、格尔必齐河外兴安岭至海为界。
中俄《尼布楚条约》里，黑龙江、乌苏里江都是中国的内河，跟黄河、长江、淮河是一样的。今天这两条河是中俄的界河，当年是内河。此后百年东北地区再无大战。
尼布楚条约中的中俄边境
大清刚刚稳定住了满洲的局势，还没来得及喘口气，又要面对气焰嚣张的漠西蒙古准嘎尔部，康熙又是怎么对付有沙俄支持的噶尔丹的呢？