1674年，吴三桂正式造反后，康熙大怒，根本不顾亲情，立即下令绞死其妹夫吴应熊和侄子吴世霖。消息传到吴三桂那里时，吴三桂听闻后伤心欲绝，因过度悲伤加上年事已高，不久就去世了。 吴三桂原先作为明朝的高级将领，在崇祯帝殉国之后，选择投降清军，打开了山海关的大门。 之后又帮助清军平定各地农民起义军，先后消灭李自成、张献忠等势力，后又将南明最后一个皇帝永历皇帝杀死，为清朝等建立立下汗马功劳。 为此，清廷不断加封吴三桂的爵位和官职，成为了大清平西王，镇守云南，成为事实上的云南王，达到了"假以便宜，不复中制，用人，兵、吏部不得制约，用财户部不得推迟"，甚至还擅自将军队扩张至10余镇，拥兵十余万。 此时吴三桂反迹未露，清朝也不敢逼反吴三桂，只得采取怀柔政策。 当时吴三桂的儿子吴应熊留在京师充当人质，顺治十四年，将皇太极的第十四女和硕公主即后来的建宁公主嫁给了他，吴应熊由此成为了大清的驸马。 虽然这是一桩政治婚姻，但是吴应熊和建宁公主却相敬如宾，两人恩爱有加，先后生育下三个子女。 远在云南的吴三桂自然对此一清二楚，但是在滔天的权势面前，亲情显得如此的脆弱。 吴三桂想要做大清"世镇云南"的平西王，而清朝则不允许有割据势力的存在，双方的矛盾愈演愈烈，达到了不可调和的地步。 当时和吴三桂一样的藩王还有两个，分别是平南王尚可喜、靖南王耿精忠，三藩势力几乎达到了全国的一半。 康熙帝继位之后，面临着"西选之官遍布天下，日练兵马，以图后事"的局面，便下定决定裁撤三藩。 康熙六年，吴三桂为了试探朝廷对他的态度，借口自己眼睛不好，向康熙帝请求解除总督云贵的职务。 康熙帝顺水推舟，下诏由云贵督抚负责接管，云贵等地的督抚上书康熙帝要求仍然让吴三桂掌控云贵，康熙帝果断拒绝。 吴三桂由此可以探明朝廷的态度，削藩是必然趋势，自己要做出抉择了。 康熙十二年十一月，吴三桂诛杀云南巡抚朱治国，逮捕了一众不顺从自己的官员，发布檄文，自称："原山海关总兵官，今奉旨总统天下水陆兵马大元帅，兴明讨逆大将军"，拥立所谓了先皇三太子，起兵反清。 一时间，云贵各地纷纷响应。 年仅二十岁的康熙丝毫没有预料到三藩之乱所带来了巨大冲击，几乎是在一瞬间，清朝就丢失了云、贵、川、闽、粤、桂诸省。 吴三桂趁势迅速向湖南推进，控制整个湖南，占领了重镇岳阳，同时王辅臣联络准噶尔军队在北方策应吴三桂。 远在台湾的郑经在听说中原大乱之后，也出兵袭扰东南封锁长江口，整个长江以南脱离了清朝的控制，康熙帝见三藩势力大，一度萌生出退出山海关的念头。 在短暂的混乱之后，康熙帝和众大臣们商讨之后得出一个结论，必须与三藩对抗到底。 或许是为了泄愤，或是为了表明自己的决心，康熙帝当即派人逮捕了吴三桂的儿子吴应熊及其子女，也就是自己的姑父和表弟。 在纳兰明珠等人的建议下，康熙帝决定绞死吴应熊，以壮军心。 当消息传到吴三桂的耳中时，他当即倒地昏迷，吴三桂醒来之后，痛骂康熙，身体状况也每况愈下。 同时由于康熙帝采取正确的策略，对付吴三桂以防守为主，主动出击北方的王辅臣，经过三年的苦战逼迫王辅臣投降，成为三藩之乱的转折点。 而吴三桂则放弃进攻富饶的江西，专向进攻秦蜀之地，遭到了清军的严防死守，最终错失良机。 所谓福无双至，祸不单行，不久之后，耿精忠和尚可喜归降清朝，三藩已经去其二，吴三桂陷入到极其被动的地步，由攻转守。 此时的吴三桂已经到了油灯枯尽的地步，再出昏招，决定在衡阳登基为帝，册封吴应熊的嫡长子世蟠为皇太孙。 登基后的吴三桂迅速失去了明朝遗老遗少的支持，民心士气大损。 加上吴三桂忧虑过度，很快便病死在衡阳，仅仅只当了五个多月的皇帝。 吴三桂死后，叛军已经是强弩之末，康熙十七年，清军先后收复川渝等地，康熙二十年，攻占昆明，吴世蟠兵败自杀，历时八年之久的三藩之乱最终得以平定。
