1948年末，国民党败局已定，大员们纷纷开始安排自己的退路。病情已十分严重的陈果夫捷足先登，于12月6日晚10时登上“中兴轮”，举家迁往台湾，定居于台中双十路八号。 1926年，陈果夫在党内崭露头角。蒋介石任命他为组织部秘书，主要负责处理一个棘手问题——共产党员在国民党中占据过多要职。彼时的组织部内，国民党仅有3个名额，而共产党却占据了26个席位，力量对比悬殊，连蒋介石都一时无计可施。 然而，陈果夫却展现出惊人的政治手腕。他有条不紊地进行＂清共＂行动，仅用一个多月时间，便＂名正言顺＂地迫使共产党员离开组织部，同时将曾养甫、郑异等亲信安插其中，完成了组织部的大规模换血，使之成为清一色的国民党人马。 汉口会议后，蒋介石一度被免去所有职务，陈果夫培养的亲信也遭到西山会议派瓦解。但他仍忠实执行蒋介石的指示，继续在组织部门推进＂清共＂工作，导致江西各地共产党组织损失惨重。 在南京政府成立的过程中，陈果夫暗中为蒋介石积蓄力量。他在上海创办了＂中央俱乐部＂，在南京四牌楼设立＂中央党务学校＂，培养了大批忠于蒋介石的党务骨干。 1929年，国民党召开全体大会，经过一年的精心布局，陈果夫掌控的势力大量进入国民党决策层，他本人更是出任组织部的第一长官，将国民党的人事任命大权牢牢握在手中。至此，＂蒋家天下陈家党＂的局面正式形成，也是后来所谓＂CC系＂的由来。 有趣的是，陈果夫本人却从不承认CC系的存在。无论人们将这一派系解释为＂中央俱乐部＂的英文缩写，还是陈氏兄弟名字的汉语拼音首字母，陈果夫都断然否认这个派系的存在，甚至当面斥责道：＂以我的性格，是不会用外国字组织自己的团体的。党章规定不得有小组织，总裁更是不允许这个组织存在的。＂ 然而，口头否认归否认，陈果夫却实实在在地利用自己的派系力量在各省广泛渗透，挖阎锡山、冯玉祥等军阀的墙角。在蒋介石的授意下，他还成立了＂中统＂，专职负责特务工作，成为蒋介石最为倚重的情报机构之一。 1931年，长期饱受肺病折磨的陈果夫将组织部长官的职位交给了弟弟陈立夫，自己则出任江苏省主席。到此时，兄弟二人已经在党务系统深耕多年，培养了大量亲信人马，他们的势力深入到国民党的方方面面——金融、行政、军事等领域都有CC系人马的身影。 然而，西安事变成为陈果夫政治生涯的一个转折点。当蒋介石被张学良、杨虎城扣留时，陈果夫兄弟坚决站在了主战派一边。陈果夫以江苏省主席的名义致电全国，表达了坚决镇压张学良、杨虎城的决心。这一立场显然忽视了＂覆巢之下，安有完卵＂的道理——武力对抗只会危及蒋介石的生命安全。若非宋子文、孔祥熙等人居中斡旋，以何应钦、陈果夫为首的主战派很可能会在无意中断送蒋介石的性命。 1948年末，国民党在大陆的战局已呈溃败之势。长江以北的大部分土地陷落，各地解放军势如破竹。曾经叱咤风云的国民党大员们，此时纷纷为自己安排后路。身患重病的陈果夫比其他人先行一步，于12月6日晚10时登上＂中兴轮＂，带着全家人撤往台湾，定居在台中双十路八号。 彼时的陈果夫已不复往日威风，但他仍是CC系的核心人物，在党内有着广泛的影响力。他选择提前离开大陆，一方面是因为病情日益严重，另一方面也是对国民党败局的清醒认识。作为党务系统多年的掌舵人，陈果夫比大多数人更早看清了形势的发展。 然而，陈果夫没有想到的是，噩梦并没有随着他撤退台湾而结束，反而才刚刚开始。1949年1月21日，蒋介石宣布引退，由李宗仁代行总统职权。蒋介石本人则前往台湾＂隐居＂，实际上是为随后的政权转移做准备。到了同年12月，蒋介石正式宣布迁都台北，国民党统治中心彻底转移到台湾岛。 随着国民党政权迁台，蒋介石急需找到一个替罪羊来为大陆的失败负责。而长期执掌党务大权的陈果夫兄弟，自然成了最理想的目标。蒋介石复职后不久，便找来陈立夫进行谈话，直截了当地问道：＂大陆失败的责任，由谁承担？＂ 处境尴尬的陈立夫不得不低头认错：＂党的方面责任最大，我和果夫有不可推卸的责任，我们还是退下来的好。＂陈立夫本想以退为进，表明认错态度后再徐图复起，却没料到蒋介石只是淡淡地＂嗯＂了一声，连客套话都懒得多说，就批准了兄弟俩的辞职请求。 消息传到病榻上的陈果夫耳中，这位曾经的党务铁腕不禁长叹：＂他这是为蒋经国铺路啊。＂陈果夫的话并非无的放矢。国民党撤退台湾后，原先的四大家族只剩下蒋家和陈家。长期占据党内核心位置的陈果夫兄弟是蒋经国上升道路上的最大障碍。为了让儿子顺利接班，蒋介石必须彻底清除陈氏兄弟在党内的影响力。 执掌党务大权长达22年之久的陈果夫，一夜之间成了一个彻彻底底的普通人。而他的弟弟陈立夫更惨，连最基本的退休待遇都没有得到保障。
